Монастырский комплекс расположен в Архангельской области, на Соловецких островах, находящихся в акватории Белого моря. Они считаются своеобразными морскими воротами, символично открывающими путь к Онежской губе. Центральная усадьба Соловецкого мужского монастыря размещена на юго-западе самого крупного острова архипелага — Большого Соловецкого, в границах древней одноименной крепость.