Городской архитектор Н.И. Ужумедский-Грицевич разработал проект церкви. Возведение началось в 1859 г. В 1860 г. Синод сообщалось, что церковь «кладкою окончена», хотя внутри еще ставили иконостасы, белым камнем выстилали полы, закупили колокола. 11 декабря 1860 г. Нижегородский епископ Нектарий освятил главный престол, 14 и 16 декабря — приделы. Первоначально церковь была освящена во имя Петра, Алексия и Ионы, митрополитов Московских с двумя приделами евангелиста Луки, Николая Чудотворца и апостола Иасона. В советское время церковь была закрыта, использовалась как общежитие. В 1998 г. церковь была возвращена епархии и начата реставрация силами Серафимо-Дивеевского монастыря. В 2004 г. главный престол церкви был переосвящен во имя Петра, Алексия, Ионы и Филиппа, митрополитов Московских, и Ермогена, патриарха Всероссийского. В настоящее время является подворьем Серафимо-Дивеевского монастыря
